3 boyutlu ablasyon sistemleri için özel kateterler ve bilgisayar sistemleri kullanılır, bu nedenle normal klasik ablasyona göre daha pahalıdır ve maliyeti daha fazladır. Ayrıca bu sistemler 3 boyutlu ablasyon konusunda özel olarak eğitim almış tecrübeli hekim ve ekip tarafından kullanılabilmektedir. 3 boyutlu sistemin olması demek haritanın kendiliğinden oluşacağı ve işlemin çok kolay olacağı anlamına gelmez. Sonuçta kateteri kullanan ve en doğru haritayı çıkaran insan faktörüdür yani hekimin ve ekibin becerisi ve tecrübesidir. Haritayı oluşturan her nokta sistemi kullanan hekimin ve ekibin incelemesinden geçer. Bu nedenlerle bu sistemler sadece ileri düzey ablasyon tecrübesine sahip merkezlerde mevcuttur. İşlemin başarı ve risk oranlarının en önemli belirleyicisi her zaman hekimin ve ekibin tecrübesidir.